上世纪80年代，原宁夏大学、宁夏农学院、宁夏工学院启动了学科建设工作。原宁夏大学从1991年召开第一届科研工作会议开始，学校采取措施加强重点学科建设，从人力、财力和物力上给予优先支持和保证。1994年原宁夏大学汉语言文字学，宁夏农学院草业科学、作物栽培学与耕作学被确定为首批自治区级重点学科。

2001年，原宁夏大学专门史等8个学科，原宁夏农学院草业学科等4个学科被批准为自治区重点学科。2006年，民族学等5门学科被批准为自治区重点学科，2013年，恢复生态学被批准为自治区重点学科。

2008年9月，学校进入 “211工程”国家重点建设高校，重点学科建设是“211工程”建设的核心,在“211工程”三期建设中，学校对7个“211”重点学科，1个“211”重点培育学科进行了立项建设。

2011年，学校开展“学科建设年”活动，大力推进学科建设，同年，草业科学被批准为国家重点学科，中国少数民族史被批准为国家重点培育学科。水利水电工程学科被学校确定为宁夏大学国家重点学科培养学科。

2014年，生物化学与分子生物学等4个学科被批准为自治区优势特色学科。2015年,电子科学与技术等4个学科被批准为“十三五”自治区优势特色学科，中国少数民族史等8个学科被批准为“十三五”自治区重点学科。

2017年1月16日，自治区西部一流大学和一流学科建设启动会在我校召开。我校有10个学科获得自治区立项支持，其中国内一流建设学科（A类）4个，分别为：草学、民族学、水利工程、化学工程与技术， 西部一流建设学科（B类）6个，分别为：计算机科学与技术、机械工程、园艺学、理论经济学、生物学、生态学。

2017年9月，化学工程与技术入选世界一流建设学科，我校成为世界一流学科建设高校。

2021年5月，自治区教育厅公布宁夏高校一流学科二期（2021—2025 年）建设名单，学校16个学科获得立项建设，其中，5个国内一流学科（A类）：民族学、草学、化学工程与技术、水利工程、园艺学；6个西部一流学科（B类）：生物学、计算机科学与技术、生态学、理论经济学、机械工程、马克思主义理论；5个“双一流”重点培育学科：教育学、中国语言文学、外国语言文学、数学、畜牧学。

2022年2月，化学工程与技术入选第二轮“双一流”建设学科。

截至2023年10月，学校现有“化学工程与技术”1个国家“双一流”建设学科，“化学工程与技术”和“民族学”2个部区合建优势特色学科群，“草业科学”1个国家重点学科、“中国少数民族史”1个国家重点（培育）学科。18个自治区重点学科，8个“十三五”自治区优势特色学科、8个“十三五”自治区重点学科，16个自治区一流建设学科。7个一级学科博士点，31个一级学科硕士点，19个专业硕士学位授权点，3个博士后科研流动站。